По мнению аналитика Ассоциации содействия самоорганизации населения Алексея Колесникова, конфликты среди территориальных общин возникают из-за процесса их объединения. Это может нести угрозу безопасности их жителей.
Также безопасности таких объединений угрожает вопрос распределения финансов и появляющиеся на этой почве разногласия. Также особую остроту приобретают земельные конфликты и борьба сельских элит за власть.
По словам Колесникова, основной угрозой безопасности объединений территориальных общин является их противостояние с районным начальством.
Отмечалось, что надзор районов, в которых большинство сел или все села объединились, уже не нужен. Но районная ветвь власти все же есть, и она вынуждена передавать полномочия, собственность, увольнять персонал. Это создает некое поле для сопротивления происходящим процессам. Подпитывает этот конфликт отсутствие ответа на вопрос, кем и чем будут эти районы потом, рассказал эксперт.