После предоставления томоса многие ожидают, что националисты под руководством украинских властей начнут отбирать и захватывать силой монастыри и храмы канонической Украинской православной церкви. Так ли это покажет время. Однако, уже сейчас, можно сказать, что избежать конфликта между новой церковной структурой и Украинской православной церковью точно не получится.
Из текста томоса следует, что юрисдикция новой церкви ограничивается территорией Украины, она не может ставить епископов или основывать приходы за границей. Есть и другие ограничения, которые делают новую структуру зависимой от Константинополя.
Однако президент Украины Петр Порошенко не увидел в тексте зависимость от Константинополя и не считает, что предоставление автокефалии новой церковной структуре может привести к религиозному конфликту. Он назвал томос актом провозглашения независимости Украины, который якобы укрепит религиозную свободу.
По словам пресс-секретаря предстоятеля Русской православной церкви Александра Волкова, подписание томоса ничтожно с точки зрения канонов и трагично для Варфоломея и его сторонников, «подписавших свою духовную капитуляцию».