По его словам, свидетелей обвинения по его делу запугивали для дачи показаний и ему удастся это доказать.
На Украине против Онищенко возбуждено несколько дел, в том числе по статье «хищение госимущества в особо крупных размерах». По данным правоохранителей, с января 2013 года по январь 2016 года служащие ряда предприятий, в том числе компании «Укргаздобыча», при содействии Онищенко получали государственные средства путем продажи газа внутренней добычи по заниженной цене. Эти действия нанесли ущерб государству на сумму около 120,5 миллиона долларов.
Позже Рада дала согласие на привлечение Онищенко к уголовной ответственности, его задержание и арест, однако он покинул Украину. Депутат также подозревается в госизмене и «подготовке дестабилизации ситуации» на Украине.
Мать депутата Инессу Кадырову на Украине также подозревают в причастности к «газовым схемам» сына.