Марк Евгеньевич Ткачук родился 26 сентября 1966 года в г. Сороки Молдавской ССР.
В 1989 году с отличием окончил исторический факультет Кишинёвского государственного университета.
С 1982 года работал в составе археологических экспедиций АН МССР (Рудь, Старый Орхей).
В 1987 году был принят в штат сектора славяно-молдавской археологии Отдела археологии АН.
С 1990 года по 1992 год — стажёр Античного сектора Института истории материальной культуры (ИИМК) в Санкт-Петербурге.
В 1991 году завершил обучение в школе полевой археологии в Саттон-Ху, графство Стаффолк (Великобритания).
С 1992 по 1994 год — аспирант ИИМК РАН.
В 1995 году защитил кандидатскую диссертацию.
С 1995 по 1998 год являлся старшим научным сотрудником Института археологии АН РМ. С 1997 года по 2000 год являлся Председателем научно-образовательного Центра «Рудь-Мэтониум». В течение длительного времени ведёт раскопки на городище Рудь, идентифицируемом с городом «Мэтонием» Клавдия Птолемея.
С 1998 года — ректор, а с 2011 года — Президент Университета «Высшая Антропологическая Школа».
С 2000 года — главный редактор журнала по антропологии и археологии STRATUM plus.
С марта 2001 года по июнь 2002 года являлся депутатом Парламента Республики Молдова, членом Постоянного бюро Парламента РМ.
С ноября 2008 года — руководитель Центра ЦК ПКРМ «Выборы-2009».
23 мая 2014 года — добровольно сложил с себя полномочия депутатского мандата.
8 декабря 2020 года решением учредительного съезда Партии коллективного действия — Гражданский конгресс, был избран одним из 17 членов Исполнительного комитета партии, а также членом Республиканского комитета.
Профилем ответственности Марка Ткачука в Исполкоме Гражданского конгресса является реализация представленного им на Съезде «Плана действий — Молдова 2020-2025».