Родился 5 ноября 1944 года в семье священника, в селе Корытное Вашковецкого, ныне Вижницкого района Черновицкой области.
В 1964 году закончил обучение в Черновицком техническом училище, по окончании которого работал в строительных организациях.
С 1970 года в течение 18 лет принадлежал к братии Троице-Сергиевой лавры, где одновременно с учёбой нес разные послушания. В 1972 году окончил Московскую духовную семинарию.
Пострижен в монашество 18 марта 1971 года с именем Онуфрий в честь преподобного Онуфрия Великого, менее через год — 29 мая 1972 года рукоположен в иеромонаха.
Окончил в 1978 году Московскую духовную академию со степенью кандидата богословия, которой удостоился за работу на тему «Пастырское служение преподобного Иова, игумена Почаевского».
Принял участие в Харьковском соборе Украинской церкви в 1992 году, занял бескомпромиссную позицию по отношению к низложенному на соборе и впоследствии анафематствованному Филарету. Возведен в сан архиепископа и назначен постоянным членом Священного синода УПЦ 28 июля 1994 года.
Священным синодом Украинской православной церкви 24 февраля 2014 года тайным голосованием избран на должность местоблюстителя Киевской митрополичьей кафедры в связи с невозможностью осуществлять исполнение обязанностей предстоятеля митрополитом Владимиром (Сабоданом) по состоянию здоровья, он скончался 5 июля того же года.
Избран и наречен новым предстоятелем Украинской православной церкви по результатам тайного голосования 13 августа 2014 года.
В тот же день патриарх Кирилл, согласно сообщению на официальном сайте Московского патриархата, «утвердил решение Собора епископов Украинской православной церкви и преподал митрополиту Онуфрию патриаршее благословение на вступление в должность предстоятеля Украинской православной церкви».
Неоднократно выступал за прекращение войны на востоке Украины.
Является сторонником единства канонической Украинской православной церкви и противником так называемой Православной церкви Украины, созданной Константинопольским патриархатом при активном участии Петра Порошенко. В сентябре 2018 включён в базу сайта «Миротворец» с обнародованием личных данных как «агент влияния РПЦ и противник создания независимой поместной Церкви на Украине».