Служба безопасности Украины задержала Вышинского в Киеве 15 мая 2018 года по обвинению в государственной измене. Тогда же прошли многочасовые обыски у него в квартире, в редакционных офисах агентства и в квартирах нескольких его коллег.
По версии следствия, Вышинский оказывал поддержку народным республикам Донбасса и якобы готовил некие журналистские материалы, поддерживающие возвращение Крыма в состав России.
По мнению генерального директора МИА «Россия сегодня» Дмитрия Киселева, арест Вышинского связан с тем, что Киев намерен запустить конвейер по обмену заложниками, в рамках которого он будет посылать на территорию РФ террористов, а потом обменивать их на журналистов.