Родился 2 мая 1974 года в Кривом Роге (Днепропетровская область).
По специальности — юрист, окончил Академию труда и социальных отношений в Киеве.
Женат, есть сын. Супруга — Оксана Лазаренко, согласно уставным документам, является руководителем зарегистрированной на Кипре компании Green Family Ltd, которая является основателем и конечным бенефициаром «Студии Квартал-95».
Карьерный путь будущего первого замглавы СБУ предопределила дружба с детских лет с Владимиром Зеленским, который 20 мая 2019 года вступил в должность президента Украины.
В январе 2013 года Баканов встает во главе «Студии Квартал-95».
Спустя три года Баканов стал числиться номинальным главой партии «Слуга народа», которая, по его собственному признанию, была формально зарегистрирована для того, чтобы просто «застолбить» данный бренд, отсылающий к одноименному сериалу с Зеленским в главной роли.
Во время предвыборной кампании Зеленского Баканов возглавлял штаб кандидата.
22 мая 2019 года получил назначение первым заместителем председателя СБУ и начальником Главного управления по борьбе с коррупцией и организованной преступностью Центрального управления Службы безопасности.
28 мая 2019 года назначен членом СНБО Украины.
Член Национального совета по вопросам антикоррупционной политики (с 16 июля 2019).
29 августа 2019 года на первом заседании Верховной рады Украины lX созыва был утверждён в качестве Главы Службы безопасности Украины (СБУ).